Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
THY1P04216 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THY1P04216 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THY1P04216 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THY1P04216 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THY1P04216 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THY1P04216 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THY1P04216 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THY1P04216 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THY1P04216 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THY1P04216 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THY1P04216 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THY1P04216 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THY1P04216 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THY1P04216 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
THY1P04216 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
THY1P04216 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THY1P04216 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THY1P04216 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THY1P04216 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THY1P04216 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THY1P04216 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THY1P04216 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THY1P04216 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THY1P04216 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THY1P04216 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THY1P04216 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THY1P04216 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THY1P04216 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THY1P04216 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THY1P04216 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
THY1P04216 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THY1P04216 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THY1P04216 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THY1P04216 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THY1P04216 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THY1P04216 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THY1P04216 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THY1P04216 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THY1P04216 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THY1P04216 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THY1P04216 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THY1P04216 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THY1P04216 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THY1P04216 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THY1P04216 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THY1P04216 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THY1P04216 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THY1P04216 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THY1P04216 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THY1P04216 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THY1P04216 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THY1P04216 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THY1P04216 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THY1P04216 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THY1P04216 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THY1P04216 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms