Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1SWP03999 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN1SWP03999 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN1SWP03999 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms