Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HBE1P02100 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HBE1P02100 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HBE1P02100 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBE1P02100 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBE1P02100 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBE1P02100 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBE1P02100 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBE1P02100 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBE1P02100 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBE1P02100 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HBE1P02100 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBE1P02100 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBE1P02100 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBE1P02100 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBE1P02100 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBE1P02100 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HBE1P02100 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HBE1P02100 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBE1P02100 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBE1P02100 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBE1P02100 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBE1P02100 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBE1P02100 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBE1P02100 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBE1P02100 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBE1P02100 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBE1P02100 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBE1P02100 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBE1P02100 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HBE1P02100 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HBE1P02100 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HBE1P02100 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HBE1P02100 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HBE1P02100 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HBE1P02100 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HBE1P02100 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HBE1P02100 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBE1P02100 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBE1P02100 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBE1P02100 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms