Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POMCP01189 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POMCP01189 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POMCP01189 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POMCP01189 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POMCP01189 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POMCP01189 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POMCP01189 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POMCP01189 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POMCP01189 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POMCP01189 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POMCP01189 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POMCP01189 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POMCP01189 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POMCP01189 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POMCP01189 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POMCP01189 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POMCP01189 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POMCP01189 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POMCP01189 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POMCP01189 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POMCP01189 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POMCP01189 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POMCP01189 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POMCP01189 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POMCP01189 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POMCP01189 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POMCP01189 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POMCP01189 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POMCP01189 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POMCP01189 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POMCP01189 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POMCP01189 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POMCP01189 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POMCP01189 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POMCP01189 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POMCP01189 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POMCP01189 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POMCP01189 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POMCP01189 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POMCP01189 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POMCP01189 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POMCP01189 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POMCP01189 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POMCP01189 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POMCP01189 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POMCP01189 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POMCP01189 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POMCP01189 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POMCP01189 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POMCP01189 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POMCP01189 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POMCP01189 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POMCP01189 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POMCP01189 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POMCP01189 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POMCP01189 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POMCP01189 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POMCP01189 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POMCP01189 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POMCP01189 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POMCP01189 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POMCP01189 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POMCP01189 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POMCP01189 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POMCP01189 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POMCP01189 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POMCP01189 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POMCP01189 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POMCP01189 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POMCP01189 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POMCP01189 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POMCP01189 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POMCP01189 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POMCP01189 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POMCP01189 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POMCP01189 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POMCP01189 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POMCP01189 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms