Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EGFRP00533 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EGFRP00533 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EGFRP00533 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EGFRP00533 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EGFRP00533 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EGFRP00533 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EGFRP00533 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EGFRP00533 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EGFRP00533 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EGFRP00533 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EGFRP00533 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EGFRP00533 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EGFRP00533 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EGFRP00533 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EGFRP00533 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EGFRP00533 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EGFRP00533 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EGFRP00533 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EGFRP00533 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EGFRP00533 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EGFRP00533 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EGFRP00533 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EGFRP00533 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EGFRP00533 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EGFRP00533 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EGFRP00533 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
EGFRP00533 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EGFRP00533 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EGFRP00533 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EGFRP00533 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EGFRP00533 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EGFRP00533 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EGFRP00533 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EGFRP00533 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EGFRP00533 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EGFRP00533 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EGFRP00533 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EGFRP00533 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EGFRP00533 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EGFRP00533 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EGFRP00533 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EGFRP00533 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EGFRP00533 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EGFRP00533 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EGFRP00533 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EGFRP00533 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EGFRP00533 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EGFRP00533 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EGFRP00533 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EGFRP00533 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EGFRP00533 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EGFRP00533 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EGFRP00533 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EGFRP00533 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EGFRP00533 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EGFRP00533 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EGFRP00533 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EGFRP00533 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EGFRP00533 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EGFRP00533 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EGFRP00533 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EGFRP00533 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EGFRP00533 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EGFRP00533 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EGFRP00533 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EGFRP00533 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EGFRP00533 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EGFRP00533 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EGFRP00533 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EGFRP00533 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EGFRP00533 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EGFRP00533 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EGFRP00533 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EGFRP00533 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EGFRP00533 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EGFRP00533 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EGFRP00533 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EGFRP00533 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EGFRP00533 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EGFRP00533 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EGFRP00533 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EGFRP00533 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EGFRP00533 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EGFRP00533 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EGFRP00533 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EGFRP00533 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EGFRP00533 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EGFRP00533 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EGFRP00533 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EGFRP00533 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EGFRP00533 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EGFRP00533 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EGFRP00533 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EGFRP00533 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EGFRP00533 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EGFRP00533 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EGFRP00533 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EGFRP00533 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EGFRP00533 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms