Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIC3O95833 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIC3O95833 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms