Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24AO95486 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms