Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR4O95473 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR4O95473 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR4O95473 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR4O95473 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR4O95473 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR4O95473 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR4O95473 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR4O95473 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR4O95473 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR4O95473 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR4O95473 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR4O95473 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR4O95473 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR4O95473 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR4O95473 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR4O95473 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR4O95473 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGR4O95473 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR4O95473 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms