Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATE1O95260 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATE1O95260 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATE1O95260 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATE1O95260 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATE1O95260 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATE1O95260 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATE1O95260 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATE1O95260 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATE1O95260 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATE1O95260 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATE1O95260 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATE1O95260 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATE1O95260 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATE1O95260 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATE1O95260 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATE1O95260 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATE1O95260 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATE1O95260 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATE1O95260 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATE1O95260 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATE1O95260 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATE1O95260 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATE1O95260 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATE1O95260 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATE1O95260 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATE1O95260 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATE1O95260 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATE1O95260 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATE1O95260 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATE1O95260 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATE1O95260 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATE1O95260 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATE1O95260 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATE1O95260 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATE1O95260 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATE1O95260 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATE1O95260 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATE1O95260 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATE1O95260 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATE1O95260 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATE1O95260 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATE1O95260 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATE1O95260 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATE1O95260 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATE1O95260 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATE1O95260 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATE1O95260 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATE1O95260 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATE1O95260 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATE1O95260 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATE1O95260 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATE1O95260 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATE1O95260 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATE1O95260 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATE1O95260 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATE1O95260 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATE1O95260 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATE1O95260 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATE1O95260 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATE1O95260 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATE1O95260 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATE1O95260 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATE1O95260 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATE1O95260 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATE1O95260 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATE1O95260 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATE1O95260 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATE1O95260 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATE1O95260 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATE1O95260 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATE1O95260 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATE1O95260 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATE1O95260 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATE1O95260 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATE1O95260 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATE1O95260 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATE1O95260 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms