Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UFL1O94874 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UFL1O94874 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UFL1O94874 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UFL1O94874 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UFL1O94874 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UFL1O94874 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UFL1O94874 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UFL1O94874 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UFL1O94874 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UFL1O94874 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UFL1O94874 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UFL1O94874 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UFL1O94874 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UFL1O94874 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UFL1O94874 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
UFL1O94874 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UFL1O94874 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UFL1O94874 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UFL1O94874 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UFL1O94874 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UFL1O94874 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UFL1O94874 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UFL1O94874 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UFL1O94874 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UFL1O94874 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UFL1O94874 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UFL1O94874 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
UFL1O94874 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UFL1O94874 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UFL1O94874 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UFL1O94874 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UFL1O94874 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
UFL1O94874 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UFL1O94874 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UFL1O94874 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UFL1O94874 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UFL1O94874 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UFL1O94874 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UFL1O94874 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UFL1O94874 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UFL1O94874 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UFL1O94874 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UFL1O94874 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UFL1O94874 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UFL1O94874 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UFL1O94874 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
UFL1O94874 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UFL1O94874 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UFL1O94874 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UFL1O94874 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UFL1O94874 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UFL1O94874 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UFL1O94874 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UFL1O94874 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UFL1O94874 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UFL1O94874 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UFL1O94874 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
UFL1O94874 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UFL1O94874 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UFL1O94874 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UFL1O94874 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UFL1O94874 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UFL1O94874 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UFL1O94874 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
UFL1O94874 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
UFL1O94874 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UFL1O94874 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UFL1O94874 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UFL1O94874 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UFL1O94874 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UFL1O94874 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UFL1O94874 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UFL1O94874 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UFL1O94874 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UFL1O94874 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UFL1O94874 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UFL1O94874 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UFL1O94874 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UFL1O94874 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UFL1O94874 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UFL1O94874 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UFL1O94874 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UFL1O94874 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UFL1O94874 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UFL1O94874 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UFL1O94874 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UFL1O94874 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UFL1O94874 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UFL1O94874 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UFL1O94874 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UFL1O94874 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
UFL1O94874 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UFL1O94874 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UFL1O94874 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UFL1O94874 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UFL1O94874 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UFL1O94874 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
UFL1O94874 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
UFL1O94874 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms