Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
DCTN3O75935 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN3O75935 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms