Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN15O75808 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN15O75808 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN15O75808 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN15O75808 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN15O75808 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN15O75808 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CAPN15O75808 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN15O75808 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN15O75808 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN15O75808 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN15O75808 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN15O75808 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN15O75808 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN15O75808 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN15O75808 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN15O75808 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN15O75808 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN15O75808 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN15O75808 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN15O75808 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN15O75808 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN15O75808 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN15O75808 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN15O75808 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN15O75808 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN15O75808 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN15O75808 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN15O75808 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN15O75808 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CAPN15O75808 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN15O75808 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN15O75808 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CAPN15O75808 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAPN15O75808 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms