Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCATO75600 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GCATO75600 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCATO75600 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCATO75600 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCATO75600 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GCATO75600 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCATO75600 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCATO75600 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCATO75600 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCATO75600 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCATO75600 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCATO75600 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCATO75600 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCATO75600 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCATO75600 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCATO75600 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCATO75600 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCATO75600 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCATO75600 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCATO75600 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCATO75600 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCATO75600 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCATO75600 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCATO75600 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCATO75600 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCATO75600 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCATO75600 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCATO75600 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCATO75600 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCATO75600 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCATO75600 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCATO75600 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCATO75600 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCATO75600 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GCATO75600 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GCATO75600 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCATO75600 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCATO75600 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCATO75600 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCATO75600 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCATO75600 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCATO75600 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCATO75600 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCATO75600 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCATO75600 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCATO75600 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCATO75600 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCATO75600 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GCATO75600 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCATO75600 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCATO75600 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCATO75600 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GCATO75600 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCATO75600 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCATO75600 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCATO75600 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCATO75600 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCATO75600 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCATO75600 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCATO75600 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCATO75600 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCATO75600 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCATO75600 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCATO75600 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCATO75600 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCATO75600 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCATO75600 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCATO75600 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GCATO75600 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCATO75600 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCATO75600 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCATO75600 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCATO75600 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCATO75600 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCATO75600 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCATO75600 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCATO75600 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCATO75600 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCATO75600 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCATO75600 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCATO75600 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCATO75600 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCATO75600 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCATO75600 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCATO75600 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCATO75600 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCATO75600 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCATO75600 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCATO75600 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms