Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF2O60811 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms