Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP104O60308 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP104O60308 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP104O60308 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP104O60308 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP104O60308 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP104O60308 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP104O60308 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP104O60308 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP104O60308 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP104O60308 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP104O60308 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP104O60308 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP104O60308 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP104O60308 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP104O60308 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP104O60308 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP104O60308 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP104O60308 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP104O60308 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP104O60308 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP104O60308 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP104O60308 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP104O60308 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP104O60308 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP104O60308 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP104O60308 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP104O60308 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP104O60308 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP104O60308 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP104O60308 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP104O60308 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP104O60308 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP104O60308 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP104O60308 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP104O60308 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP104O60308 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP104O60308 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP104O60308 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP104O60308 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP104O60308 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP104O60308 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP104O60308 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP104O60308 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP104O60308 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP104O60308 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP104O60308 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP104O60308 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CEP104O60308 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP104O60308 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP104O60308 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP104O60308 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP104O60308 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP104O60308 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP104O60308 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP104O60308 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP104O60308 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP104O60308 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP104O60308 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP104O60308 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP104O60308 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP104O60308 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP104O60308 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP104O60308 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP104O60308 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP104O60308 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP104O60308 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms