Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDELR3O43731 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR3O43731 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR3O43731 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms