Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID2O43424 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID2O43424 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID2O43424 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRID2O43424 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID2O43424 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID2O43424 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID2O43424 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID2O43424 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRID2O43424 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID2O43424 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID2O43424 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID2O43424 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID2O43424 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID2O43424 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID2O43424 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID2O43424 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID2O43424 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRID2O43424 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID2O43424 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID2O43424 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID2O43424 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID2O43424 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRID2O43424 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID2O43424 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID2O43424 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID2O43424 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRID2O43424 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRID2O43424 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID2O43424 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID2O43424 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID2O43424 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID2O43424 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID2O43424 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID2O43424 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID2O43424 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRID2O43424 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRID2O43424 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRID2O43424 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRID2O43424 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRID2O43424 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRID2O43424 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRID2O43424 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRID2O43424 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRID2O43424 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRID2O43424 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRID2O43424 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRID2O43424 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRID2O43424 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID2O43424 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID2O43424 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID2O43424 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID2O43424 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID2O43424 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID2O43424 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID2O43424 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRID2O43424 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID2O43424 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID2O43424 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID2O43424 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRID2O43424 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID2O43424 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID2O43424 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID2O43424 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRID2O43424 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID2O43424 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID2O43424 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRID2O43424 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID2O43424 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID2O43424 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID2O43424 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID2O43424 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID2O43424 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID2O43424 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID2O43424 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID2O43424 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID2O43424 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRID2O43424 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRID2O43424 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID2O43424 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID2O43424 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID2O43424 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID2O43424 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID2O43424 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID2O43424 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID2O43424 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID2O43424 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRID2O43424 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID2O43424 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRID2O43424 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms