Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA3O43365 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA3O43365 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA3O43365 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms