Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZZEF1O43149 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZZEF1O43149 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZZEF1O43149 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms