Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR3AO14802 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR3AO14802 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR3AO14802 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms