Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC9O14530 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC9O14530 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms