Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE40O14503 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BHLHE40O14503 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE40O14503 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE40O14503 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE40O14503 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE40O14503 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE40O14503 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE40O14503 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE40O14503 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE40O14503 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE40O14503 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE40O14503 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE40O14503 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE40O14503 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE40O14503 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE40O14503 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE40O14503 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE40O14503 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE40O14503 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE40O14503 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE40O14503 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE40O14503 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE40O14503 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE40O14503 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE40O14503 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE40O14503 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE40O14503 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE40O14503 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE40O14503 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE40O14503 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE40O14503 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE40O14503 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE40O14503 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE40O14503 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE40O14503 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE40O14503 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE40O14503 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE40O14503 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE40O14503 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE40O14503 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE40O14503 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE40O14503 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE40O14503 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE40O14503 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHLHE40O14503 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms