Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFRA2O00451 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms