Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIC1O00299 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIC1O00299 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms