Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DEV8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DEV8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DEV8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DEV8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DEV8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DEV8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DEV8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DEV8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DEV8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DEV8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DEV8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DEV8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DEV8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DEV8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DEV8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DEV8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DEV8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DEV8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DEV8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DEV8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B4DEV8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DEV8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DEV8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DEV8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DEV8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DEV8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DEV8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DEV8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DEV8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DEV8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DEV8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DEV8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DEV8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DEV8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DEV8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DEV8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DEV8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DEV8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DEV8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DEV8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DEV8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DEV8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DEV8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DEV8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DEV8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DEV8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DEV8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DEV8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DEV8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DEV8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DEV8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DEV8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DEV8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DEV8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4DEV8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4DEV8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4DEV8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DEV8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DEV8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DEV8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms