Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMIM23A6NLE4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM23A6NLE4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms