Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAF2A6NFQ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms