Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPN1LA6NDY0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPN1LA6NDY0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms