Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC13A5PLN9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms