Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRAMEF22A3QJZ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms