Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LNP1A1A4G5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LNP1A1A4G5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LNP1A1A4G5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms