Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms