Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms