Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD2Q9NZN4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms