Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RSPO3Q9BXY4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms