Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms