Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF4BQ92750 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms