Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC17Q8N6Y2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms