Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RFPL4BQ6ZWI9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RFPL4BQ6ZWI9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RFPL4BQ6ZWI9 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RFPL4BQ6ZWI9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RFPL4BQ6ZWI9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RFPL4BQ6ZWI9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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