Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZCCHC12Q6PEW1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms