Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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