Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKOR2Q2VWA4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms