Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5B1Q2VPB7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms