Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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