Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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VAMP3Q15836 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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