Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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