Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.681e-7■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 NDUFA10-211ENST00000476216 817 ntTSL 28.65□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 NDUFA10-208ENST00000444548 621 ntTSL 38.05□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 NDUFA10-209ENST00000448880 434 ntTSL 53.39□□□□□ -1.873e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 RNF31-211ENST00000559275 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.944e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 PHPT1-205ENST00000492540 1316 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.434e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 BMPR1A-205ENST00000638429 5632 ntTSL 516.95■□□□□ 0.36e-7■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.886e-7■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.767e-8■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.013e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 LIN28B-202ENST00000635857 912 ntTSL 516.12■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 19.5
PCBP2Q15366 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.792e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ATG4B-225ENST00000494465 2365 ntTSL 516.28■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.436e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 IQGAP2-217ENST00000514350 2617 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.096e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ZDHHC14-202ENST00000341375 1934 ntTSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.352e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-9■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 HDLBP-246ENST00000496569 374 ntTSL 411.4□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 HDLBP-207ENST00000420451 559 ntTSL 49.97□□□□□ -0.814e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 HDLBP-206ENST00000417540 525 ntTSL 49.57□□□□□ -0.884e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 HDLBP-230ENST00000462130 464 ntTSL 49.44□□□□□ -0.94e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.745e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.876e-9■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.636e-9■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.446e-9■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.466e-9■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MSI2-207ENST00000579205 500 ntTSL 414.42□□□□□ -0.13e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 27.96□□□□□ -1.144e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MSI2-216ENST00000582772 398 ntTSL 35.1□□□□□ -1.593e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 54.24□□□□□ -1.734e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ARID1B-231ENST00000637887 1468 ntTSL 56.18□□□□□ -1.422e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.342e-10■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 CES2-202ENST00000417689 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-10■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 CES2-201ENST00000317091 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-10■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-232ENST00000561425 582 ntTSL 519.41■□□□□ 0.72e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.172e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.172e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-228ENST00000560975 2855 ntTSL 516.01■□□□□ 0.152e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-211ENST00000558314 1031 ntTSL 1 (best)14.31□□□□□ -0.122e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.132e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-230ENST00000561266 671 ntTSL 313.16□□□□□ -0.32e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.492e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-227ENST00000560970 1039 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.82e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-212ENST00000558347 1525 ntTSL 59.81□□□□□ -0.842e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TPM1-233ENST00000610733 3957 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.912e-12■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 SLC16A3-216ENST00000583025 955 ntTSL 218.19■□□□□ 0.59e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 FLOT1-202ENST00000413165 856 ntTSL 518.74■□□□□ 0.593e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ANO9-208ENST00000534161 2158 ntTSL 216.75■□□□□ 0.273e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ANO9-207ENST00000532094 5487 ntTSL 216.73■□□□□ 0.273e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ANO9-206ENST00000528927 2639 ntTSL 1 (best)16.04■□□□□ 0.163e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 FLOT1-204ENST00000418160 457 ntTSL 314.77□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 FLOT1-206ENST00000445853 792 ntTSL 1 (best)11.39□□□□□ -0.593e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 FLOT1-203ENST00000416018 592 ntTSL 310.99□□□□□ -0.653e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 CMBL-206ENST00000511963 796 ntTSL 38.77□□□□□ -1.014e-9■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 CMBL-205ENST00000510532 701 ntTSL 36.99□□□□□ -1.294e-9■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.44e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-213ENST00000464344 3993 ntTSL 312.12□□□□□ -0.472e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 PEX11B-202ENST00000428634 667 ntTSL 211.74□□□□□ -0.534e-6■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-211ENST00000455202 2626 ntTSL 211.68□□□□□ -0.542e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-202ENST00000391980 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-219ENST00000493169 576 ntTSL 410.1□□□□□ -0.792e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-215ENST00000476564 614 ntTSL 210.02□□□□□ -0.812e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-217ENST00000480298 585 ntTSL 49.52□□□□□ -0.892e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-209ENST00000439144 583 ntTSL 39.46□□□□□ -0.92e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-201ENST00000241527 4529 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.952e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.082e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-203ENST00000401626 561 ntTSL 57.25□□□□□ -1.252e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.274e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.372e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.572e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-206ENST00000414146 457 ntTSL 55.21□□□□□ -1.582e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.614e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 MTERF4-207ENST00000424798 797 ntTSL 54.74□□□□□ -1.652e-8■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.344e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.064e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.944e-7■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.518e-9■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.628e-9■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.728e-9■■■■□ 19.4
PCBP2Q15366 TSPAN4-217ENST00000527644 968 ntTSL 224.8■■□□□ 1.564e-6■■■■□ 19.4
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 128.3 ms