RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614476.4

MTERF4-222, Transcript of mitochondrial transcription termination factor 4, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MTERF4, Length 4,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTERF4-222	ENST00000614476	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		16.08	■□□□□ 0.17
MTERF4-222	ENST00000614476	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MTERF4-222	ENST00000614476	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		14.27	□□□□□ -0.13
MTERF4-222	ENST00000614476	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
MTERF4-222	ENST00000614476	HRC	P23327	699 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MTERF4-222	ENST00000614476	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MTERF4-222	ENST00000614476	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MTERF4-222	ENST00000614476	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MTERF4-222	ENST00000614476	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MTERF4-222	ENST00000614476	MYT1	Q01538	1121 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MTERF4-222	ENST00000614476	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MTERF4-222	ENST00000614476	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MTERF4-222	ENST00000614476	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MTERF4-222	ENST00000614476	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
MTERF4-222	ENST00000614476	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MTERF4-222	ENST00000614476	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MTERF4-222	ENST00000614476	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MTERF4-222	ENST00000614476	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MTERF4-222	ENST00000614476	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MTERF4-222	ENST00000614476	ABCC9	O60706	1549 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MTERF4-222	ENST00000614476	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MTERF4-222	ENST00000614476	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
MTERF4-222	ENST00000614476	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
MTERF4-222	ENST00000614476	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MTERF4-222	ENST00000614476	SCRIB	Q14160	1630 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MTERF4-222	ENST00000614476	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		12.92	□□□□□ -0.34
MTERF4-222	ENST00000614476	APLP2	Q06481	763 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MTERF4-222	ENST00000614476	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
MTERF4-222	ENST00000614476	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
MTERF4-222	ENST00000614476	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
MTERF4-222	ENST00000614476	NACAD	O15069	1562 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MTERF4-222	ENST00000614476	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MTERF4-222	ENST00000614476	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
MTERF4-222	ENST00000614476	NEUROD1	Q13562	356 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MTERF4-222	ENST00000614476	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
MTERF4-222	ENST00000614476	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
MTERF4-222	ENST00000614476	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MTERF4-222	ENST00000614476	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
MTERF4-222	ENST00000614476	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
MTERF4-222	ENST00000614476	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		12.58	□□□□□ -0.4
MTERF4-222	ENST00000614476	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MTERF4-222	ENST00000614476	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MTERF4-222	ENST00000614476	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
MTERF4-222	ENST00000614476	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MTERF4-222	ENST00000614476	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MTERF4-222	ENST00000614476	NEFL	P07196	543 aa		12.46	□□□□□ -0.42
MTERF4-222	ENST00000614476	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
MTERF4-222	ENST00000614476	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MTERF4-222	ENST00000614476	MIER1	Q8N108	512 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MTERF4-222	ENST00000614476	EEA1	Q15075	1411 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MTERF4-222	ENST00000614476	WIZ	O95785	1651 aa		12.3	□□□□□ -0.44
MTERF4-222	ENST00000614476	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
MTERF4-222	ENST00000614476	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		12.29	□□□□□ -0.44
MTERF4-222	ENST00000614476	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	12.27	□□□□□ -0.45
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MTERF4-222	ENST00000614476	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
MTERF4-222	ENST00000614476	ITGAE	P38570	1179 aa		12.23	□□□□□ -0.45
MTERF4-222	ENST00000614476	BCAN	Q96GW7	911 aa		12.21	□□□□□ -0.45
MTERF4-222	ENST00000614476	SMARCA4	P51532	1647 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MTERF4-222	ENST00000614476	GOLGA3	Q08378	1498 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MTERF4-222	ENST00000614476	CEP162	Q5TB80	1403 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MTERF4-222	ENST00000614476	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MTERF4-222	ENST00000614476	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
MTERF4-222	ENST00000614476	SMARCA2	P51531	1590 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MTERF4-222	ENST00000614476	ABCC8	Q09428	1581 aa		12.15	□□□□□ -0.47
MTERF4-222	ENST00000614476	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MTERF4-222	ENST00000614476	CLIP1	P30622	1438 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MTERF4-222	ENST00000614476	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MTERF4-222	ENST00000614476	SOGA1	O94964	1423 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MTERF4-222	ENST00000614476	FKBP8	Q14318	412 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MTERF4-222	ENST00000614476	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
MTERF4-222	ENST00000614476	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
MTERF4-222	ENST00000614476	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MTERF4-222	ENST00000614476	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MTERF4-222	ENST00000614476	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MTERF4-222	ENST00000614476	KIF27	Q86VH2	1401 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MTERF4-222	ENST00000614476	ANP32C	O43423	234 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MTERF4-222	ENST00000614476	P3H3	Q8IVL6	736 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MTERF4-222	ENST00000614476	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MTERF4-222	ENST00000614476	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MTERF4-222	ENST00000614476	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MTERF4-222	ENST00000614476	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
MTERF4-222	ENST00000614476	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MTERF4-222	ENST00000614476	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MTERF4-222	ENST00000614476	FBLN2	P98095	1184 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MTERF4-222	ENST00000614476	CUX2	O14529	1486 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MTERF4-222	ENST00000614476	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MTERF4-222	ENST00000614476	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MTERF4-222	ENST00000614476	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MTERF4-222	ENST00000614476	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MTERF4-222	ENST00000614476	NCAPD3	P42695	1498 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MTERF4-222	ENST00000614476	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MTERF4-222	ENST00000614476	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.82	□□□□□ -0.52
MTERF4-222	ENST00000614476	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MTERF4-222	ENST00000614476	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
MTERF4-222	ENST00000614476	CCER2	I3L3R5	266 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MTERF4-222	ENST00000614476	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
MTERF4-222	ENST00000614476	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
MTERF4-222	ENST00000614476	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		11.79	□□□□□ -0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms