Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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