Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PMS2P3Q13401 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PMS2P3Q13401 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PMS2P3Q13401 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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